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Calculator Plugins


Calculator Plugins는 ChemAxons의 다양한 응용프로그램들에서 사용될 수 있는 구조 기반 예측 도구입니다. 단일 또는 복수의 화합물 구조들을 MarvinSketch와 MarvinView의 Tools 메뉴에서 처리할 수 있습니다. 일괄 처리를 하기 위해서는 command line을 사용해야 합니다(via cxcalc).

Calculator Plugins은 아래에 구분된 것과 같은 기능 영역 중 유저가 선택한 항목에 따라 라이센스가 발급됩니다. 또한 단일 처리 또는 일괄 처리인지, unlimited Calculator Pack인지 등으로 라이센스가 구분됩니다. 모든 라이센스는 모든 ChemAxon 응용프로그램 및 toolkit에서 사용됩니다.


Free unlimited online tryout, please visit this link (Java required) - opens in new window.

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JKlustor


ChemAxon의 JKlustor Suite은 화합물 라이브러리에서 유사성 또는 구조 기반 뿐만 아니라 다양성에 기반한 클러스터링을 수행하여 계층적/비계층적 방식으로 하위 세트를 선택하고, molecular fingerprint나 다른 descriptor들을 가지고 라이브러리 비교를 수행합니다. 이것은 조합 화학(combinatorial chemistry), 가상 라이브러리 디자인, 또는 많은 수의 화합물을 분석해야 하는 다양한 영역의 연구에 필수적인 도구입니다.


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Reactor


화학 반응의 가상 목록은 가상 화합물 라이브러리 디자인에서 매우 강력한 도구 입니다. Reactor는 ChemAxon JChem 기술의 가상 화학 반응 목록 엔진으로, 일반적인 반응 방정식을 반응의 규칙들과 함께 지원함으로써 시약을 미리 정해놓지 않고도 화학적으로 가능한 결과물을 생성 할 수 있습니다. Reactor는 주어진 화학 반응에서 지원되는 주 생성물을 수동으로 선택할 수 있을 뿐만 아니라 고도로 자동적인 화학 반응 계산을 수행할 수 있습니다.



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Screen


대용량 분자 데이터베이스의 Ligand-based screening은 신약 개발의 초기 단계에서 매우 유용한 도구입니다. Screen Suite은 ligand-based 초고속 가상 검색 패키지로, 대용량 화합물 라이브러리의 chemical (2D) 및 shape (3D) 유사성 검색에서 강력한 기능을 제공합니다. 또한 Screen은 몇몇 dissimilarity metrics 및 최적의 검색 결과를 얻을 수 있도록 프로세스를 조정하는데 사용할 수 있는 metrics optimization 뿐만 아니라 ChemAxon chemical fingerprint나 pharmacophore fingerprint, ECFP/FCFP와 같은 몇몇 fingerprint 세트를 제공합니다.



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Fragmenter


Fragmenter는 ChemAxon의 JChem 기술 중 화합물 fragment를 만드는 구성요소 입니다. 해당 모듈은 다양한 분열 규칙에 기반하여 화합물 구조들을 쪼개어서 fragment 집합들을 만들어내는 기능을 제공합니다. Fragmenter는 매우 빠른 fragmentation 알고리즘으로 사용자가 다양하게 정의한 변환 규칙들을 적용할 수 있습니다.




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Metabolizer preview


약물 후보의 체내 대사(metabolism)는 신약 개발 과정의 주요한 문제 입니다. 약물의 비활성화, 약물 전구체의 활성화 및 약리 활성을 갖는 대사 산물들은 유기체에 유해한 생물학적 영향을 미칠 수 있습니다. Metabolizer는 generation-based 방식으로 주어진 기질의 가능한 모든 대사 산물(metabolite)을 예측해주는 ChemAxon의 솔루션 입니다. 해당 모듈은 체내 대사 경로의 in silico 예측 도구로서, 전임상 신약 탐색 및 독성학 연구에 도움을 줄 수 있습니다.

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