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작성일 : 11-11-22 17:17
[Software] [Tripos] SYBYL Tips & Tricks: Topomer Scaffold Search 결과를 활용한 새로운 분자 구조 생성
 글쓴이 : 티앤제이테크 (210.♡.60.161)
조회 : 6,404  
오늘은 지난번 SYBYL Tips & Tricks에서 말씀 드렸던 대로 Topomer scaffold search 결과를 활용하여 새로운 molecule을 만드는 스크립트를 소개해 드리겠습니다. 해당 스크립트(scaffenum.spl)를 활용하면 virtual screening을 통해 얻은 새로운 scaffold들을 기존에 가지고 있던 reference molecule의 scaffold 자리에 치환하여 새로운 분자 구조 데이터베이스를 손쉽게 만들 수 있습니다. 또한 이렇게 생성된 데이터베이스는 docking이나 pharmacophore modeling 등 virtual screening 이 후에 진행할 작업의 input으로 바로 사용될 수 있습니다. 첨부된 scaffold_enumerator.zip 파일에는 scaffenum.spl과 예제 데이터가 포함되어 있으며 scaffold_enumerator.pdf 파일에서 해당 스크립트의 사용법이 안내되어 있습니다. 알려드린 tip이 프로그램을 활용하시는 데 유용하게 쓰일 수 있으면 좋겠습니다. Topomer Search에 대해 더 궁금하시다면 언제든지 연락 주십시오. 담당자: 조해림 E-mail: hlcho@tnjtech.co.kr