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작성일 : 11-09-26 17:07
[Tripos] Application Note: ADMET Modeling: Application of the topohERG Model
 글쓴이 : 티앤제이테크 (210.♡.60.161)
조회 : 4,751  
   http://www.tripos.com/index.php?family=Modules,General.DownloadPortal,… [1290]
QT 간격이 길어지는 것은 hERG 칼륨 이온 채널 차단에 의해 야기되는 심각한 부작용 입니다. 이러한 부작용은 생명을 위협하는 심장부정맥으로 이어질 수 있으므로 drug discovery의 초기 단계에서 hERG 문제를 밝혀내는 것이 중요합니다. 따라서 hERG 활성에 대한 예측 도구가 요구되는데, 이번 Application Note에서는 그 도구의 하나로
Bayer사의 연구자들에 의해 개발되고 발표된‘topoHERG model’을 소개하고 있습니다. 해당 모델은 Tripos의 SYBYL-X에서 실제 데이터에 적용해 볼 수 있습니다.

topohERG 모델을 적용하려면 아래와 같이 3개의 파일이 필요합니다.
• query structure (unknown hERG activity)
• reference set
• SPL macro to perform the prediction

이 중 reference set과 SPL macro은 링크를 통해 Tripos 홈페이지에서 다운 받으실 수 있습니다. (이 때 홈페이지에 사용자 정보를 등록 후 로그인 하셔야 합니다.)

추가로, hERG 활성이 알려지지 않은 query structure가 hERG 활성이 알려진 reference dataset의 이웃 화합물인지를 식별하기 위해 Tripos의 Topomer Search 기술을 활용하는 과정을 거치게 됩니다. 즉, Topomer Search를 사용하여 query structure가 주어진 topohERG model로 예측 가능한 영역에 있는지를 확인합니다.

자세한 내용은 첨부된 pdf 파일을 참조해 주십시오.