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작성일 : 11-08-24 09:16
[Tripos] Application Note: Capturing SAR Trends from Chemogenomical Spaces
 글쓴이 : 티앤제이테크 (210.♡.60.161)
조회 : 5,277  
   http://www.springerlink.com/content/9kq370130562q807/abstract/ [2194]
구조-활성 상관관계는 새로운 화합물의 합성을 필요로 하는 신약 개발 과정에서 매우 중요한 정보입니다. 화학유전체학 분야의 출현으로 막대한 양의 구조-활성 데이터들이 만들어졌고 일반에 공개되었습니다. 따라서 이러한 데이터들 더욱 잘 활용하기 위해 SAR(Structure-Activity Relationship) 경향성 밝혀낼 수 있는 능력이 더욱 요구됩니다. Tripos 사의 SYBYL-X에 실행될 QSEA(Quantitative Series Enrichment Analysis) 방법은 화학유전체 데이터베이스에서 SAR를 자동화된 과정으로 포착해 낼 수 있도록 해 줄 것 입니다. 이 application note에서는 Topomer Search와 Topomer CoMFA 기능을 통합적으로 활용한 QSEA 방법을 설명하고 있습니다.

그 방법을 간단히 요약해보면 다음과 같습니다.
1. 한 개의 화합물과 구조와 활성 정보가 포함된 한 개의 데이터베이스가 주어집니다.
2. 주어진 구조를 query로 하여 데이터베이스에서 Topomer Search를 사용한 shape similarity search를 수행합니다.
3. 2에서 나온 similarity 정보를 활용하여 SAR 테이블들을 구성합니다.
4. 3에서 구성된 각각의 SAR 테이블들에서 다음과 같은 방식으로 반복적인 Topomer CoMFA modeling을 수행합니다.
 1) 중심 molecule 지정
 2) Topomer distance (similarity)가 가까운 순서대로 3개의 molecule을 포함하여 Topomer CoMFA model 생성
 3) Molecule을 하나씩 추가하여 해당 SAR 테이블 안의 모든 molecule을 포함할 때까지 반복적으로 Topomer CoMFA model 생성

위의 과정을 통해 데이터베이스 상에 존재하는 다양한 화합물들의 구조적, 통계적 특징을 SAR에 기반하여 분석하는 것이 가능하며, 이것은 새로운 유사체를 설계하는데 큰 도움이 될 것 입니다.