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작성일 : 09-07-13 10:22
[Surflex-Dock] Multi-Docking tutorial
 글쓴이 : 티앤제이테크 (210.♡.60.176)
조회 : 9,510  
첨부파일은 Surflex-Dock에서 Multi-docking 기능의 사용법을 익힐 수 있는 tutorial을 제공합니다.

Tutorial에는 5개의 protein conformation target과 7개의 ligand가 사용되며 1개의 ligand pose docking당 약 30초의 시간이 소요됩니다.
이와 같은 조건으로 시작했을때, 일반 docking의 경우 1개의 ligand 당 10분 내외의 시간이 소요되지만 rescoring의 경우 ligand 1개당 30분 이상의 시간이 소요될 수도 있으므로 빠른 tutorial 실행을 원하신다면 초기 단계에서 protein conformation target의 수를 줄여서 실행해 보시는 것을 권장합니다.

다음 링크를 따라가시면 개발자(A. Jain)가 사용한 실제 데이터 세트를 다운 받으실 수 있습니다.
Jain JCAMD 2009 Test Data (Protein Flexibility)